Akademi Keuangan dan Perbankan Tahuna dipimpin oleh seorang Direktur dan dibantu oleh 3 (3) orang Pembantu Direktur, serta didukung oleh unsur pelaksana akademik. Pelaksanaan tugas senantiasa memperhatikan aturan yang ditetapkan dan disepakati bersama. Suasana dalam organisasi baik institusi maupun di program studi sangat kondusif sehingga tugas yang diamanahkan selalu dapat dilaksanakan dengan sebaik-baiknya dengan penuh rasa tanggung jawab. Tentunya hambatan dalam pelaksanaan tugas selalu ada tetapi dengan adanya komitmen yang tinggi dari staf untuk melaksanakan tugas dan tanggung jawab secara baik dan transparan, maka semuanya dapat diselesaikan secara baik dengan menjunjung tinggi etik moral sejalan dengan budaya organisasi lembaga.
Periode kepemimpinan sebagai DIrektur di AKP GMIST Tahuna sejak berdiri pada tahun 1997 s/d sekarang adalah sebagai berikut :
1. Periode 1997 – 2001
Periode 2001 – 2005 : Drs. H. Karendesang, S.m.Psi
2. Periode 2005 – 2009 : Jantje Liatahi, SE
3. Periode 2009 – 2013
Periode 2013 s/d 2019 : Arther Rawuaten, SE, M.Si
4. Periode 2019 – Sekarang : Alvinson Ireneus Sentinuwo, SE.Ak, ME
